转生眼作为火影忍者中白眼的终极进化形态，其能力设定包含毁灭创世之力，但官方资料并未明确提及副作用。根据剧场版和衍生内容，转生眼的开启需要结合大筒木一族的查克拉与日向一族的纯净白眼，这一过程本身可能伴随风险。转生眼的两种形成方式中，由大量白眼融合而成的类型具有永久性，而个体进化类型在摘除后会退化为普通白眼，暗示其存在不稳定性。从能力表现来看，转生眼虽能操控引力、召唤石像或进入查克拉模式，但过度使用可能对使用者身体或精神造成负荷。
转生眼的查克拉抽取能力存在限制，无法对白眼持有者生效，且非羽村后裔接触时会被强制抽离查克拉。这种特性可能对使用者产生反噬，尤其是在对抗日向一族时。转生眼的空间操控与傀儡控制需消耗巨量查克拉，若使用者基础不足，可能导致查克拉枯竭。剧场版中舍人借助转生眼控制月球轨道的情节显示，这类宏观操纵需持续维持，对使用者的精神力要求极高。
从生物学角度分析，转生眼与写轮眼、轮回眼同为血继限界的顶点，但后两者明确存在视力衰退或生命消耗等副作用，而转生眼的副作用更偏向隐性。其精神控制能力若频繁使用，可能干扰使用者自身的意志。另据设定，转生眼查克拉模式下的求道玉攻击虽强，但需精准控制查克拉流动，操作失误可能引发能量失控。
综合现有资料，转生眼的副作用更多体现在使用条件与潜在风险上，而非直接的身体损伤。其力量源于血脉与瞳术融合，若强行开启或过度依赖，可能打破使用者自身的查克拉平衡。在实战中，需权衡转生眼的战略价值与对战斗节奏的影响，避免因能力反噬陷入被动。
